20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1785 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  100 
 
 		 374 aa  725    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  41.55 
 
 		 332 aa  249  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  25.5 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  26.69 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  26.26 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  24.4 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  24.48 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  21.47 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  23.15 
 
 		 545 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  23.63 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  27.89 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  22.71 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  22.37 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  27.08 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  23.72 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  25.7 
 
 		 536 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  26.56 
 
 		 350 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  25.47 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  24.78 
 
 		 271 aa  43.1  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>