26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1271 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  93.48 
 
 
107 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  72.64 
 
 
102 aa  153  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  70.3 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  68.87 
 
 
103 aa  144  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  42.39 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  40.4 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  36.79 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  37.76 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  38.2 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  37.93 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  36.26 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  36.78 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  36.78 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  36.26 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  34.02 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  37.36 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  39.51 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  27.08 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  31.25 
 
 
98 aa  58.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  30 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  30 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  28.26 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>