21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0126 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0126  putative transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 93 aa  181  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000113795  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0130  hypothetical protein  65.71 
 
 		 73 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00208659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0889  CopG domain protein DNA-binding domain protein  36.56 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.259319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1157  putative transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  35.8 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  47.37 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1578  putative transcriptional regulator, CopG family  32.05 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1267  putative transcriptional regulator, CopG family  36.26 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  32.93 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0507  nickel responsive regulator  45.65 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  47.37 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  47.37 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2743  CopG family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00281756  hitchhiker  0.00032337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2273  putative transcriptional regulator, CopG family  30.77 
 
 		 94 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2839  putative transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  47.37 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2041  CopG family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000563555  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3094  putative transcriptional regulator, CopG family  30.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>