17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3510 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3510  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.26644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2715  hypothetical protein  81.15 
 
 
248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4145  hypothetical protein  59.17 
 
 
252 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4749  hypothetical protein  58.87 
 
 
246 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1313  hypothetical protein  58.82 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1814  hypothetical protein  55.37 
 
 
246 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6879  hypothetical protein  57.27 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0994967  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2809  hypothetical protein  37.95 
 
 
256 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555734  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0976  hypothetical protein  36.16 
 
 
248 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0915  hypothetical protein  36.16 
 
 
236 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3370  hypothetical protein  39.27 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1382  hypothetical protein  35.27 
 
 
248 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.42725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3672  hypothetical protein  39.73 
 
 
250 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0858  hypothetical protein  28.79 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0399112  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3433  hypothetical protein  25.14 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2380  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2227  hypothetical protein  21.15 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>