29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2446 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  77.29 
 
 		 295 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  70.85 
 
 		 290 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  72.2 
 
 		 288 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  73.68 
 
 		 286 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  74.81 
 
 		 273 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  72.1 
 
 		 285 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  43.53 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  43.53 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  43.56 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  42.52 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  42.46 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  40.07 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  39.63 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  41.94 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  36.72 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  35.59 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  34.84 
 
 		 279 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  35.42 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  35.42 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  34.51 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  34.51 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  33.86 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  30.97 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  27.84 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  28.35 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  25.68 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  22.09 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>