49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0831 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  75.14 
 
 		 174 aa  285  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  67.66 
 
 		 176 aa  253  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  56.73 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  61.08 
 
 		 166 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  52.12 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  48.48 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  46.06 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  31.33 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  33.1 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  30.2 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  30.67 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  32.41 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  29.05 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  29.14 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  27.89 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  25.52 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  27.52 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  26.85 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  27.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.38 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  28.79 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  26.14 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  27.46 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  25.5 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  24.31 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  30.23 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  25.87 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  26.67 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  23.45 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  26.88 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  28.26 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  23.45 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  23.81 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  32.91 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  26.75 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  27.73 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  26.47 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  25.49 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  22.39 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>