18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4693 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 385 aa  753    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  35.06 
 
 		 491 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  29.34 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  25.74 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  23.65 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  29.47 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  25.59 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  30.63 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  34.48 
 
 		 427 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  28.57 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  23.99 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  29.26 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  28.48 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  34.39 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  26.92 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  29.81 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3589  Lantibiotic modifying protein-like protein  29.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  30.22 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>