18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4448 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4448  hypothetical protein  100 
 
 		 683 aa  1381    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9392  hypothetical protein  24.81 
 
 		 724 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.12 
 
 		 558 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.37 
 
 		 455 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00586249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5537  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30 
 
 		 741 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.422743 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0907  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.7 
 
 		 744 aa  52  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00620171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  30.34 
 
 		 1484 aa  50.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.79 
 
 		 1446 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2461  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.83 
 
 		 836 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1482  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.97 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0176325  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.28 
 
 		 1346 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1456  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.08 
 
 		 962 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000268755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7855  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.8 
 
 		 879 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.628926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.91 
 
 		 881 aa  45.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.07008  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07170  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  23.08 
 
 		 1050 aa  44.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.712631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08760  cell divisionFtsK/SpoIIIE  20.98 
 
 		 758 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00860549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0006  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.75 
 
 		 501 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5430  cell division protein FtsK/SpoIIIE  26.53 
 
 		 1303 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>