14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4231 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4231  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.744504  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2991  hypothetical protein  44.09 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0556  hypothetical protein  38.73 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0050  hypothetical protein  32.46 
 
 
224 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0560  hypothetical protein  32.46 
 
 
224 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0346  hypothetical protein  34.98 
 
 
198 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01430  hypothetical protein  36.28 
 
 
232 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0808  hypothetical protein  35.02 
 
 
260 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1320  hypothetical protein  33.01 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6023  hypothetical protein  61.54 
 
 
93 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.63 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3860  hypothetical protein  44.19 
 
 
103 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6668  hypothetical protein  54.29 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117127  normal  0.660583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0220  hypothetical protein  38.27 
 
 
230 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.259398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>