28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3539 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  155  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  56.25 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  45.07 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  45.07 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  45.07 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8454  hypothetical protein  52.24 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  50.82 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  51.56 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  51.72 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1784  hypothetical protein  58.82 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00678784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  50.77 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7210  hypothetical protein  47.76 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  49.28 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1761  hypothetical protein  49.23 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000459552  normal  0.237306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  45.07 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  51.92 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1599  hypothetical protein  46.3 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.124638  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3453  hypothetical protein  56.06 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  40.85 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  43.08 
 
 
153 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  43.64 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1048  hypothetical protein  43.55 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  38.03 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2786  hypothetical protein  42.5 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  46.94 
 
 
76 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  35 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>