13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3460 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3460  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  778    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28850  hypothetical protein  31.22 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4428  hypothetical protein  31.74 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4444  hypothetical protein  31.74 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0643  hypothetical protein  34.62 
 
 		 550 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2199  hypothetical protein  28.76 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1118  hypothetical protein  33.95 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07200  hypothetical protein  28.36 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04420  hypothetical protein  30.71 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31820  hypothetical protein  29.68 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4332  hypothetical protein  31.79 
 
 		 165 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1302  hypothetical protein  26.74 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1137  hypothetical protein  22.14 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>