12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2391 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2391  lipoprotein  100 
 
 
343 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  0.755106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5111  lipoprotein  50.64 
 
 
350 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.472196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4360  hypothetical protein  44.99 
 
 
352 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5318  hypothetical protein  50.52 
 
 
329 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03172  putative signal peptide protein  29.89 
 
 
346 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.203589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02335  hypothetical protein  30.68 
 
 
364 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4172  hypothetical protein  34.34 
 
 
349 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1343  putative secreted protein  28.74 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00928694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  27.27 
 
 
582 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6719  hypothetical protein  22.97 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.759063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2685  hypothetical protein  24.2 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  0.122648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4492  hypothetical protein  27.55 
 
 
275 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>