21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1939 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1939  protein of unknown function DUF466  100 
 
 
71 aa  146  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294211  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0335  protein of unknown function DUF466  57.97 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16570  uncharacterized small protein  50 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0421  hypothetical protein  51.56 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.849917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08620  uncharacterized small protein  53.06 
 
 
81 aa  60.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0682  hypothetical protein  45.9 
 
 
63 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.643858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4323  hypothetical protein  54.55 
 
 
45 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0832  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.619207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2309  protein of unknown function DUF466  48.28 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163671  hitchhiker  0.00083492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3362  protein of unknown function DUF466  50 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.280192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15000  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344355  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1573  hypothetical protein  48.98 
 
 
61 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.197269  normal  0.788025 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1844  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.598922  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1778  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380449  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1797  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2023  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1187  protein of unknown function DUF466  33.87 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00439042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0071  hypothetical protein  36.84 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.402388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3106  protein of unknown function DUF466  38.33 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0645  hypothetical protein  38.78 
 
 
65 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0861404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3981  protein of unknown function DUF466  38.18 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>