20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1815 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1815  VTC domain protein  100 
 
 		 319 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  60.14 
 
 		 299 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  28.38 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1407  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  26.22 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03580  VTC domain-containing protein  29.1 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2305  hypothetical protein  24.45 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1141  hypothetical protein  24.57 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0173277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  26.87 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13170  VTC domain-containing protein  27.4 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.733284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1304  hypothetical protein  26.38 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.795946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  24.67 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  24.78 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  25.51 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0374  hypothetical protein  36.27 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0701  hypothetical protein  23.56 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07681  hypothetical protein  22.54 
 
 		 238 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0997365  hitchhiker  0.000779865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3169  hypothetical protein  27.09 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33877  Phosphate metabolism transcription protein  20.69 
 
 		 781 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0517097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  24.56 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>