Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Ndas_1746 |
Symbol | |
ID | 9245596 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_014210 |
Strand | + |
Start bp | 2125233 |
End bp | 2134904 |
Gene Length | 9672 bp |
Protein Length | 3223 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 68% |
IMG OID | |
Product | amino acid adenylation domain protein |
Protein accession | YP_003679680 |
Protein GI | 297560706 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 9 |
Fosmid unclonability p-value | 0.179306 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGGCCAAGC CCGCCGTCGA AGACATCGTC GCGCTCCTCC CGGCGCAGCA GGGGATCCTC TTCCACTCCC TCTACGACGA GGCCGACCGG TCGCAGTACA CGCAGCAGGT GGCCGTCGAC ATGGACGGGC GCCTGGACGC GGAGCGGCTG CGCCGCGCGG CCCAGCGGCT CGTGGACCGG CACGCCGCCC TGCGCACGAG CTTCCACCAG AGGCGCGACG GGGAGACCGT CCAGGCCGTC AGGGAGACCG CCCCGGTCGC GTGGGCCGAA CACGTGGTGG AGGGGGAGGA CTTCGACGGG GAGTGCCGGG AGATCGTCGA GAAGGACCGC CGAGTCGCGT TCGACCTGGA GCAGGCACCG CTGGTCCGCT TCCTGCTCTT CTCCACCCCG GGGGGAGACG CCTGGCGCCT GGTCCTGAAC CAGCACCACA TCGTCGTCGA CGGATGGTCC ACCGACGTGC TCCTCGACGA CCTGTTCACC CTCTACCAGG AGGGCCCGGA CGCGCCCTCG CTGTCACCGG CGGCCCGCTT CTCCGACTAC GCGCGGTGGT TCTCCGCGCA GGGGAGGGAG GAGAGCACCC GGCTGTGGCG TGAGGAACTC AGCGGGGTCG AGGGACCCAC GCACCTGGAC CTTCCGGGGG GAGAGGACGG GCCCGCGGCC TCCGACTCCG GGCAGGTGAG GTTCGAGGTC GACGCGAAGG TGTCGGTCGC CGTCGAGTCC CTGTGCGCCG AGCACCGGGT GACGGTCAGT ACGTTCGTCC ACGCGGCGCT GTCCGTTCTG CTGGCCAGGC TCATGGGGAG GTCGCAGGTG GTCTTCGGCG CCACCAGCCA TGGACGCGAC CCCCGCTTCG ACGGTGTGGA GGGCATGGCG GGGCAGTTCG TGACGACGAT 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Protein sequence | MAKPAVEDIV ALLPAQQGIL FHSLYDEADR SQYTQQVAVD MDGRLDAERL RRAAQRLVDR HAALRTSFHQ RRDGETVQAV RETAPVAWAE HVVEGEDFDG ECREIVEKDR RVAFDLEQAP LVRFLLFSTP GGDAWRLVLN QHHIVVDGWS TDVLLDDLFT LYQEGPDAPS LSPAARFSDY ARWFSAQGRE ESTRLWREEL SGVEGPTHLD LPGGEDGPAA SDSGQVRFEV DAKVSVAVES LCAEHRVTVS TFVHAALSVL LARLMGRSQV VFGATSHGRD PRFDGVEGMA GQFVTTMPVR VDLTDATAFG ELLGALHRRH LRLLGHEDLG LFAAQEAAGI SGELFNVMVT SEQYAGAFRG DAVDGLRITR PEVTNASHYP LVLAYRTGPA FGFDLNFRTD SFDEGTVRLM GERLLRVVEQ VCADPGSAVG ALEVLVPGEG ARLRAWGTGP TTAHTPGTIV DSFRSQAERS PQAVAVESGS ERLSYAELDA RSDVFAGVLR AAGVGREVCV PVVMGRSVDV LVAFLGVLKA GGAYMPLHSG LPVGRVRELV GGSGSPVVVV DSGFVRDGAW PWGEGEGPQP VVCDHTGLAA PTVTGTDAGG VRPGQLAYVM FTSGTTGAPK GIAVTHQGVV DLATDTCWGV GAASRVLFHA PHAFDASTYE IWAALLSGGR VVVAPAGEVD AEALSRLIPV HGVTHLSLTA GMFRVVAEES VESLAGLVEV TTGGDVVSAS GVGRVVEAFP EMVVRTTYGP TEVTLCATQV PWRGGVRPGE VVPLGSGLDN TSVFVVDEGL SLVPAGVVGE LYISGAGLAR GYVNQPSLTA SRFVACPFAA GERMYRTGDL VRWTSRGELV FVGRSDDQVK VRGFRIELGE IEAATTALDG VADAVASVHR SADGDKRLVA YVVPEPGCEV DPERVRGDLG RVVPEYMVPW AVVGLESLPL TVNGKVDRTA LPAPEVASGQ GRAPRNPREE VLCGLFAQVL GVERVGIDDD FFALGGHSLS ATRLMGRVRS VLGVRAGVRA LFEAPTVAGL LPRLEGSGGS GELVGLSRVG RRPGVVPLSF AQRRLWFLSR LEGASATYNI PVVTRVRGPV DVGALGAALN DVVGRHEVLR TVFAEVNGEP VQRVLDADTG GRVELGVSEC APEDVGAVVA DHAAHLFDLE HDIPVHAHLV RVLPEAGAEQ KLAAGAEQKA DPGSSQEAAP GPVQEWVLVL VVHHIAGDGA SMGPLSRDLG QAYQARCAGQ VPRWEELPVQ YVDYALWQHE LWGSDDEPTD LAREQVGFWR QHLAGAPEEL VLPTDRPRPA VSSYQGGQVS VPATEGTLGR VRELARASGA TVFMVAQAAV AAVLSRLGAG TDIVVGTVVE GREDPALEDL VGFFVNTVVL RTDLSGDPSF AELLGRVREA DLAAFDHAQV PFERVVEALR PSRSLARHPL FQVSVAWEED GGYSGVELPG VEGVSVQVAE VAAKFDLFFG FGVDAAGGLR VSVVYSRDLF DRASARLLGE RLVRVVEQVC ADPGVAVRDL HILGPEEKHQ ILTEFNNAPG IEPRTFPALF EEWVARTPHA PALEGESQRL SYAELDARSN RVARWLVARG VGPEVPVVVS MGRGVGLVVS LLAVMKAGGV YVPVDPDYPS ARQRHIVSGT GARLALVDGT AHVPPEGIES VLLQELDLSG YGCGPLSDRD RVSALRLANT AYVIHTSGST GVPKGVAVTH TGIDRLVKRH SIDLSAGPGS RIMQTASIGF DGSVWEIAMG LLTGGCVVVG RPEDLLDAKG VTGEAGRITH LTVTPSMLAA LPDDGLPPGA VVVTASEAVT EHVVQRWARD HRLVNSYGPT ETTVCASGTE LRPGEPVTIG GPVAGTRLFV LDEGLSLVPA GVVGELYISG AGLARGYVNQ PSLTASRFVA CPFAAGERMY RTGDLVRWTQ RGELVFVGRS DDQVKVRGFR IELGEIEAAT TALDGVADAV VSVHQSADGD KRLVAYVVPE PGRAIDSERV RGDLGRVVPE YMVPWAVMAL DALPLTVNGK VDRTALPAPE VASGQGRAPR NPREEVLCGL FAQVLGVERV GIDDDFFALG GHSLSATRLM GRVRSVLGVR AGVRVLFEAP TVAGLLPRLE GSGGSGGVVG LSRVGRRPGV VPLSFAQRRL WFLSRLEGAS ATYNIPVVTR VRGPVDVGAL GAALNDVVGR HEVLRTVFAE VNGEPVQRVL EPGAARVGLG VSECAPGRVG AVVADHAAHL FDLEHDIPVH AHLVHVVPGA DGSGEEDAVH GSDPVGAFAD AASPADTGAG CVADVGEWVL VLVVHHIAGD GASMGPLSRD LGQAYQTRCS GQTPRWEELP VQYVDYALWQ HELWGSDDEP TDLAREQVEF WRQHLAGAPE ELVLPTDRPR PAVSSYQGGQ VSVPATEGTL GRVRELARAS GATVFMIAQA AVAAVLSRLG AGTDIVVGTV VEGREDPALE DLVGFFVNTV VLRTDLSGDP SFSELLGRVR EADLAAFDHA QVPFERVVEA LRPSRSLARH PLFQVSVAWE EDGGYSGVEL PGVEGVSVQV AEVAAKFDLF FGFGVDAAGG LRVSVVYSRD LFDQASARLL GERLVRVVEQ VCADPDVAVR DLHILGTDEH DRLHAWGTGP TTAHTPGTIV DSFRSQAEHS SQAVAVESGS ERLSYAELDA RSDVFAGVLR AAGVGREVCV PVVMGRSVDV LVAFLGVLKA GGAYMPLHSG LPVGRVRELV GGSGSPVVVV DSGFVRDGAW PWGEGEGPQL VVCDHTAPVP EVSEADSGLG DRGHAFPDQL AYVMFTSGTT GAPKGIAVTH QGVVDLATDT CWGVGAASRV LFHAPHAFDA STYEIWAALL SGGRVVVAPA GEVDAEALSR LIPVHGVTHL SLTAGMFRVV AEESVESLAG LVEVTTGGDV VSASGVGRVV EAFPEMVVRT TYGPTEVTLC ATQVPWRGGV RPGEVVPLGS GLDNTSVFVV DEGLSLVPAG VVGELYISGA GLARGYVNQP SLTASRFVAC PFAAGERMYR TGDLVRWTSR GELVFVGRSD DQVKVRGFRI ELGEIEAATT ALDGVADAVA SVHRSADGDK RLVAYVVPEP GCEVDPERVR GDLGRVVPEY MVPWAVVGLE SLPLTVNGKV DRTALPAPEV ASGQGRAPRN PREEVLCGLF AQVLGVERVG IDDDFFALGG HSLSATRLMG RVRSVLGVRA GVRALFEAPT VAGLLPLLDE SGPEQPSLLK KRR
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