22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5399 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  28.47 
 
 		 764 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  25.68 
 
 		 706 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  28.32 
 
 		 820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  26.22 
 
 		 919 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  26.79 
 
 		 884 aa  108  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  25.76 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  26.34 
 
 		 713 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  25.97 
 
 		 835 aa  98.2  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  39.46 
 
 		 905 aa  92  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  42.04 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  35.1 
 
 		 811 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  34.42 
 
 		 804 aa  81.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  24.44 
 
 		 814 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  33.77 
 
 		 802 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  34.44 
 
 		 809 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  34.44 
 
 		 809 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  34.44 
 
 		 809 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  30.1 
 
 		 870 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  33.06 
 
 		 831 aa  63.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  28.8 
 
 		 820 aa  48.9  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  23.37 
 
 		 741 aa  44.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>