35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4084 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000391482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5985  hypothetical protein  47.92 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2008  hypothetical protein  46.32 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  39.36 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  35.79 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  36.46 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  29.59 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  33.68 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5850  hypothetical protein  35.35 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  34.69 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  36.08 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  32.97 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  25 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  34.38 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  33.01 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  29.91 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  44.83 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  32.63 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  32.58 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  34.78 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  35.37 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>