18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2558 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3487  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000245666  normal  0.022754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00862843  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3713  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0391969  normal  0.214185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3631  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00123736  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3630  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3628    100 
 
 		 4277 bp  3092    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0797695  decreased coverage  0.00230701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3600  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0391749  normal  0.108213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183066  normal  0.0904945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000115095  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2583  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  hitchhiker  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2582  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000204702  hitchhiker  0.000111004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2560  Integrase catalytic region  100 
 
 		 924 bp  1832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000211729  normal  0.0105372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2559  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000308015  hitchhiker  0.00371198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2558    100 
 
 		 2803 bp  5557    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000161046  hitchhiker  0.00904245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  84.39 
 
 		 1236 bp  387  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4614  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  81.37 
 
 		 1242 bp  184  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1610  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  83.06 
 
 		 1242 bp  155  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  78.96 
 
 		 1245 bp  133  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00637457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>