43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2309 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2309  protein of unknown function DUF466  100 
 
 
77 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163671  hitchhiker  0.00083492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1797  hypothetical protein  73.33 
 
 
45 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1844  hypothetical protein  73.33 
 
 
45 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.598922  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1778  hypothetical protein  73.33 
 
 
45 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380449  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3106  protein of unknown function DUF466  53.45 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15000  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344355  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3362  protein of unknown function DUF466  50 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.280192  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08620  uncharacterized small protein  51.79 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0335  protein of unknown function DUF466  44.87 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16570  uncharacterized small protein  42.19 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4323  hypothetical protein  60 
 
 
45 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0832  hypothetical protein  50.88 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.619207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2023  hypothetical protein  57.78 
 
 
45 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1939  protein of unknown function DUF466  48.28 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294211  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0682  hypothetical protein  38.71 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.643858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1573  hypothetical protein  39.62 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.197269  normal  0.788025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0421  hypothetical protein  39.06 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.849917  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0645  hypothetical protein  35.09 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0861404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0581  hypothetical protein  34.25 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4937  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.793617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4944  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.786101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4858  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4784  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244344  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4885  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3225  protein of unknown function DUF466  32.88 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1090  hypothetical protein  32.88 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.926383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1404  protein of unknown function DUF466  34.55 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4879  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3644  protein of unknown function DUF466  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4573  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4945  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3713  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828713  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4893  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04185  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5865  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04219  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0759  hypothetical protein  35.14 
 
 
65 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0654  hypothetical protein  35.14 
 
 
65 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0713  hypothetical protein  35.14 
 
 
65 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.885775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0697  hypothetical protein  35.14 
 
 
65 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3928  hypothetical protein  29.03 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2251  hypothetical protein  39.13 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0640  hypothetical protein  35.14 
 
 
65 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>