26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1515 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1515  cutinase  100 
 
 
514 aa  1044    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0339808  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5603  cutinase  28.57 
 
 
236 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00618421  normal  0.511306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5223  cutinase  28.83 
 
 
236 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5311  cutinase  28.83 
 
 
236 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4966  cutinase  30.47 
 
 
205 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0417178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3344  cutinase  35.56 
 
 
225 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1514  cutinase  31.58 
 
 
235 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0692058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3177  cutinase  25.08 
 
 
243 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5793  cutinase  35.71 
 
 
233 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13488  cutinase precursor cut3  30 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.957767  normal  0.0619563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1490  cutinase  29.07 
 
 
244 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0468617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1037  cutinase  37.4 
 
 
236 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17200  Cutinase  27.27 
 
 
423 aa  47  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1939  cutinase  35.25 
 
 
241 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1893  cutinase  35.25 
 
 
241 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4432  cutinase  31.72 
 
 
226 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10346  cutinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14420)  29.2 
 
 
223 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.886788  normal  0.0228214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4300  cutinase  38.33 
 
 
244 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1440  cutinase  29.46 
 
 
222 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171019  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13489  cutinase precursor cut4  31.62 
 
 
231 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0687633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1873  cutinase  34.43 
 
 
241 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0829992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5804  cutinase  26.85 
 
 
242 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.748462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0371  cutinase  30.77 
 
 
244 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.656734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1283  cutinase  31.21 
 
 
280 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00904546  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3373  cutinase  29.89 
 
 
221 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201335  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4967  cutinase  30.46 
 
 
220 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0510354  normal  0.752129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>