37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1058 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  56.05 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  34 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  27.15 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  30.26 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  27.1 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  27.1 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  30.19 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  30.07 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  28 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  29.49 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  28.29 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1729  hypothetical protein  28.39 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000276376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  27.39 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  29.38 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1730  hypothetical protein  29.7 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000514392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  27.63 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  26.8 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  28.76 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  20.65 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  30.72 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  27.08 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  24.67 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  24.43 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  26.49 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  28.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  23.13 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  22.37 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  22.86 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>