71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1055 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  320  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  54.67 
 
 		 153 aa  173  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  52.45 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  35.56 
 
 		 142 aa  94.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  35.86 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  35.21 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  37.76 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  36 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  35.56 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  32.61 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  31.69 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  26.95 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  34.96 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  30.34 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  31.25 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  30.56 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  26.03 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.15 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  28.93 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  30.89 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  27.64 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  27.64 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  29.2 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.2 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  24.82 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  26.21 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  28.37 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  26.8 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  26.24 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.69 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  25.83 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  24.79 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  25.41 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  28.03 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  25.32 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  29.69 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  24.83 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  27.4 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  25.17 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  24.64 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  23.81 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  24.83 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  29.55 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  25.32 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  27.14 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  23.61 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  27.74 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  23.91 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  26.43 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  22.7 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  25.4 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  20.65 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  31.65 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  24.34 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  26.12 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  20.74 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  24.46 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  21.68 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3649  hypothetical protein  31.52 
 
 		 310 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  25.64 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  23.94 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  25.35 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  26.28 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  25.71 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  24.09 
 
 		 152 aa  40.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>