21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0170 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0170  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1016    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2614  hypothetical protein  43.37 
 
 
509 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000491274  normal  0.0136523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5502  hypothetical protein  42.33 
 
 
529 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000845668  decreased coverage  0.000369985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3863  hypothetical protein  30.65 
 
 
530 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2869  hypothetical protein  28.39 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2800  hypothetical protein  28.13 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0489  hypothetical protein  29.42 
 
 
540 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0248447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1493  hypothetical protein  30.15 
 
 
505 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.22386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0540  hypothetical protein  28.92 
 
 
532 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3977  hypothetical protein  25.97 
 
 
565 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_003296  RS03692  hypothetical protein  28.9 
 
 
517 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.274894  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0247  hypothetical protein  22.1 
 
 
487 aa  87  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0629  hypothetical protein  23.84 
 
 
513 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1084  hypothetical protein  34.02 
 
 
671 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0110678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0871  hypothetical protein  27.18 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2248  hypothetical protein  22.38 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000920075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1178  hypothetical protein  22.64 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0300  hypothetical protein  21.15 
 
 
498 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0380  hypothetical protein  27.43 
 
 
540 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2033  hypothetical protein  22.32 
 
 
499 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2671  hypothetical protein  33.95 
 
 
235 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>