10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0064 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0064  tRNA-Ile  100 
 
 
67 bp  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  91.49 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0004  tRNA-Met  91.49 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0049  tRNA-Met  89.36 
 
 
74 bp  54  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0031  tRNA-Met  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0028  tRNA-Met  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.260556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0028  tRNA-Met  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882337  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>