19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6063 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  70.05 
 
 
809 aa  995    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  64.2 
 
 
802 aa  911    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  70.05 
 
 
809 aa  995    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  100 
 
 
811 aa  1568    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  69.92 
 
 
809 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  82.05 
 
 
804 aa  1239    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  40.5 
 
 
831 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  36.35 
 
 
905 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  34.29 
 
 
764 aa  271  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  29.07 
 
 
706 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  41.18 
 
 
784 aa  78.2  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  35 
 
 
873 aa  75.1  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  25.6 
 
 
919 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  23.99 
 
 
713 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1447  hypothetical protein  28.34 
 
 
733 aa  50.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  34.31 
 
 
706 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  27.2 
 
 
884 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  24.44 
 
 
820 aa  45.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  31.01 
 
 
717 aa  45.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>