19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5988 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  951    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  46.43 
 
 
627 aa  295  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  44.13 
 
 
461 aa  285  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  41.43 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  33.26 
 
 
580 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  34.86 
 
 
560 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  34.88 
 
 
466 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  27.69 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  23 
 
 
414 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  30.68 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  25.44 
 
 
361 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  27.6 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  27.71 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  23.72 
 
 
375 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  25.98 
 
 
368 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  26.21 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  25.95 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6669  hypothetical protein  27.46 
 
 
473 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00124083  normal  0.737923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>