29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4295 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  89.69 
 
 
194 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  78.12 
 
 
195 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  78.12 
 
 
195 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  78.12 
 
 
195 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  62.56 
 
 
218 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  54.97 
 
 
194 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  50.52 
 
 
185 aa  160  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  48.7 
 
 
185 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1288  Domain of unknown function DUF2017  48.73 
 
 
202 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  39.69 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  34.66 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  32.04 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  37.57 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  33.15 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  33.86 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  36.22 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  34.38 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  32.11 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  34.66 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  40.54 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  36.11 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  32.04 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  30.87 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  29.88 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  30.57 
 
 
201 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  30.82 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  27.64 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>