16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3812 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3812  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  199  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.285278  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2724  hypothetical protein  90.24 
 
 
87 aa  146  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3440  hypothetical protein  75 
 
 
81 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3503  hypothetical protein  75 
 
 
81 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138277  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3451  hypothetical protein  75 
 
 
81 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12366  hypothetical protein  60.26 
 
 
97 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2738  hypothetical protein  51.32 
 
 
80 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  40.68 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  45.1 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  49.02 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  51.28 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1296  hypothetical protein  41.51 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  48.78 
 
 
113 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  35.29 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  48.72 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  54.55 
 
 
106 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>