16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1367 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1367  RNase P subunit p30  100 
 
 
233 aa  460  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  33.91 
 
 
239 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  30.43 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  32.22 
 
 
240 aa  99  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  30.77 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  30.04 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  28.63 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  28.69 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  30.99 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  30.09 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  21.26 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  21.26 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  20.69 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  21.05 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  19.63 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  30.29 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>