17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3019 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3019  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2617  hypothetical protein  42.95 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53059  normal  0.0347471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2338  hypothetical protein  42.95 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0431424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2293  hypothetical protein  41.61 
 
 
176 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2085  hypothetical protein  36.65 
 
 
170 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3900  hypothetical protein  35.9 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703088  normal  0.015774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0090  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3612  hypothetical protein  34.62 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1694  hypothetical protein  28.79 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1847  hypothetical protein  34.55 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211856  normal  0.427536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0283  hypothetical protein  29.58 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0545419  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  26.67 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  27.44 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  31.33 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  27.38 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  27.45 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  27.45 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>