17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1889 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  75 
 
 		 176 aa  269  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  51.15 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  47.16 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  44.75 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  44.44 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  38.59 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  43.58 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  38.25 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  40.22 
 
 		 275 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  40.22 
 
 		 275 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  39.78 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  38.92 
 
 		 196 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  39.01 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  39.01 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1419  hypothetical protein  26.55 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1213  hypothetical protein  28.87 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>