21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1666 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1666  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1935  hypothetical protein  47.24 
 
 
127 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0563  hypothetical protein  46.83 
 
 
120 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0562  hypothetical protein  46.83 
 
 
120 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3530  hypothetical protein  46.46 
 
 
127 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.299759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1635  hypothetical protein  46.46 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.959214  normal  0.217031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4722  hypothetical protein  44.27 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2694  hypothetical protein  46.03 
 
 
120 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4209  hypothetical protein  42.75 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1767  hypothetical protein  36.8 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4925  hypothetical protein  38.28 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.229271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0579  hypothetical protein  36.92 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0715642  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4879  hypothetical protein  44.53 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.495712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4416  hypothetical protein  44.53 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  0.635789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2046  hypothetical protein  41.6 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2931  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272823  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1202  hypothetical protein  34.88 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3312  hypothetical protein  34.62 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0937  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224562  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0824  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3935  hypothetical protein  28.03 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>