25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0980 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  56.54 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  39.75 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  39.91 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  38.3 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  39.21 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  34.89 
 
 		 238 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  36.6 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  31.84 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  27.49 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  25.96 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  30.65 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0131  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0411  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0714125  normal  0.0851261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>