13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0936 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0936  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0592  hypothetical protein  64.6 
 
 
284 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0321  hypothetical protein  27.86 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404069  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2903  hypothetical protein  26.07 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.66276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1946  hypothetical protein  25.17 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2520  hypothetical protein  25.58 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3513  hypothetical protein  24.91 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2593  hypothetical protein  24.57 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1947  hypothetical protein  21.68 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.684571  normal  0.294231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0322  hypothetical protein  21.09 
 
 
331 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143036  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2902  hypothetical protein  21.48 
 
 
332 aa  45.8  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.476659  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3747  hypothetical protein  27.27 
 
 
339 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3796  hypothetical protein  27.27 
 
 
339 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>