22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2222 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 113 aa  227  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  52.48 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  39.77 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  37.35 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  39.02 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  36.05 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  33.73 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  32.14 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  31.46 
 
 		 98 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  34.78 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  26.83 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  29.63 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  27.55 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  29.17 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  25 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  26.58 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  27.71 
 
 		 172 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  22.58 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  25.93 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  25.61 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  27.16 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  26.25 
 
 		 130 aa  40  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>