19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0746 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  60 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  37.37 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.08 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  37.97 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.16 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.23 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.14 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.8 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.475377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  34.52 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  29.21 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  31.91 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  31.91 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  31.91 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1998  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.29 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0296724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.95 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.89 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.14 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>