10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0540 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0540  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
326 aa  654    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.711778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1006  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 
343 aa  288  8e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0497  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.317622  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1612  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
342 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0669  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
348 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0637  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
393 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>