11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0338 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  264  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2777  PilT protein domain protein  30.53 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.293295  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  27.56 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2206  PilT protein domain protein  29.01 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364897  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  27 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  23.85 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>