22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0181 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  60.27 
 
 
146 aa  158  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  37.01 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  34.53 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  33.1 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  35.06 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  40.82 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  36.6 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  32.03 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  32.14 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  31.43 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  36.6 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  39.36 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  27.63 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  29.29 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  25.53 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  32.31 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  28.09 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  30.58 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>