32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4632 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 213 aa  426  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  70.5 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  70.5 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  72.77 
 
 		 207 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  61.97 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  64.74 
 
 		 209 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  46.7 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  51.67 
 
 		 202 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  48.74 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  48.94 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  46.77 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  49.47 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  50.86 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  50 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  50.29 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  45.36 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  45.88 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  45.88 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  38.59 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  37.64 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  34.24 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  32.26 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  32.11 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  32.22 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  32.6 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  30.54 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  30.54 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  29.34 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  33.52 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  29.59 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  29.86 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>