21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4201 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  100 
 
 
351 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  77.05 
 
 
336 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  75.34 
 
 
331 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  75.68 
 
 
335 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  57.1 
 
 
342 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  69.55 
 
 
334 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  55.65 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  49.82 
 
 
323 aa  246  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  49.79 
 
 
267 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  36.88 
 
 
342 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  37.82 
 
 
353 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  36.19 
 
 
309 aa  146  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  38.04 
 
 
308 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  35.1 
 
 
320 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  34.72 
 
 
316 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  36.26 
 
 
317 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  32.14 
 
 
332 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  36.4 
 
 
364 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 
321 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  31.02 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>