15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2992 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2992  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  810    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0985  hypothetical protein  39.9 
 
 
403 aa  299  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4870  hypothetical protein  41.62 
 
 
955 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5532  hypothetical protein  43.09 
 
 
396 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.232647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3426  hypothetical protein  40.71 
 
 
428 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00293967  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4943  hypothetical protein  41.22 
 
 
411 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4282  hypothetical protein  39.75 
 
 
415 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1945  hypothetical protein  40.1 
 
 
407 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00538103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4176  hypothetical protein  38.68 
 
 
415 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.616398  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3051  tetratricopeptide TPR_4  35.67 
 
 
499 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2412  hypothetical protein  30.37 
 
 
333 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3543  hypothetical protein  26.96 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655246  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.54 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  22.56 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.56 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>