32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0564 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  73.52 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  72.59 
 
 		 369 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  72.59 
 
 		 374 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  57.46 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  55.59 
 
 		 324 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  45.1 
 
 		 335 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  40.74 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  34.36 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  34.5 
 
 		 456 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  39.38 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  36.65 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  35.53 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  35.5 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  35.38 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  35.82 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  32.68 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  32.68 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  34.64 
 
 		 779 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.37 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.56 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.03 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.97 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  27.49 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  32.35 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  24.82 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  25.46 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  27.9 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  24.39 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  19.07 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  27.86 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>