29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4623 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  100 
 
 
336 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  95.76 
 
 
331 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  94.29 
 
 
335 aa  564  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  77.32 
 
 
351 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  71.75 
 
 
334 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  59.29 
 
 
342 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  59.41 
 
 
322 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  47.22 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  51.69 
 
 
267 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  37.21 
 
 
342 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  39.52 
 
 
308 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  36.66 
 
 
320 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  37.31 
 
 
309 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  38.21 
 
 
353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  36.23 
 
 
316 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  34.96 
 
 
332 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  34.55 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  36.99 
 
 
364 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  29.86 
 
 
324 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  36.99 
 
 
344 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  36.99 
 
 
344 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  32.95 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  34.21 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  42.19 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  34.38 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 
500 aa  42.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>