24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4018 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4057  hypothetical protein  91.99 
 
 
433 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4018  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  889    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142082  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3762  hypothetical protein  89.47 
 
 
433 aa  761    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.21345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4395  hypothetical protein  55.88 
 
 
436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2299  hypothetical protein  55.16 
 
 
436 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2629  hypothetical protein  52.64 
 
 
436 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3526  hypothetical protein  45.03 
 
 
336 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3342  petrobactin biosynthesis protein AsbE  39.62 
 
 
327 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000187753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1987  petrobactin biosynthesis protein AsbE  39.62 
 
 
327 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1848  hypothetical protein  38.85 
 
 
334 aa  289  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2020  petrobactin biosynthesis protein AsbE  38.36 
 
 
327 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2338e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1985  hypothetical protein  38.36 
 
 
327 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1816  hypothetical protein  38.36 
 
 
331 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1842  hypothetical protein  38.36 
 
 
331 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1799  hypothetical protein  38.05 
 
 
331 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3525  hypothetical protein  45.57 
 
 
89 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1847  acyl carrier protein  37.18 
 
 
91 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1984  acyl carrier protein  33.33 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1798  acyl carrier protein  33.33 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2019  acyl carrier protein  33.33 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04545e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1841  acyl carrier protein  33.33 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1815  acyl carrier protein  33.33 
 
 
89 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3343  acyl carrier protein  33.33 
 
 
91 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.812241  hitchhiker  0.00000000000000639555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1986  acyl carrier protein  33.33 
 
 
91 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>