20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3068 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  90.91 
 
 
55 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  81.13 
 
 
55 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  81.13 
 
 
55 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  77.36 
 
 
55 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  79.25 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  79.25 
 
 
66 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  73.58 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  71.7 
 
 
54 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  58.49 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  51.85 
 
 
57 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  54.72 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  50.94 
 
 
52 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  45.28 
 
 
54 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  45.61 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  54.72 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  41.51 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  45.76 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3155  hypothetical protein  69.7 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245214  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  42.55 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>