31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1025 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  89.43 
 
 
374 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 
361 aa  718    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  89.43 
 
 
369 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  74.03 
 
 
349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  57.83 
 
 
324 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  55.36 
 
 
342 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  43.81 
 
 
335 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  38.31 
 
 
328 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  37.19 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  33.74 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  37.25 
 
 
334 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  35.02 
 
 
456 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  36.99 
 
 
339 aa  156  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  33.87 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  33.59 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  33.13 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  33.59 
 
 
319 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  34.2 
 
 
779 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  37.12 
 
 
335 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  28.79 
 
 
323 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.34 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.09 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.85 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  27.81 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  30.15 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  31.25 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  30.37 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  25.52 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  25.56 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  36.04 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25.86 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>