18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2832 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  164  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  68 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  52.38 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  61.22 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  44.57 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  56.6 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  56.6 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  56.6 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  56.6 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  58 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  58 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  58 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  49.23 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  49.23 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  48 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>