22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1891 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  100 
 
 
353 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  39.86 
 
 
320 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  39.04 
 
 
309 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  38.06 
 
 
316 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  36.39 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  37.46 
 
 
342 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  37.13 
 
 
332 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  37.5 
 
 
317 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  38.97 
 
 
335 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  38.1 
 
 
351 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  38.77 
 
 
336 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  38.24 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  38.64 
 
 
323 aa  166  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  37.87 
 
 
334 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  37.63 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  41.63 
 
 
322 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  40 
 
 
267 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  34.8 
 
 
364 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  30.28 
 
 
324 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  26.81 
 
 
321 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
344 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>