28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1605 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1605  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  307  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.02 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5827  hypothetical protein  31.98 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6979  hypothetical protein  35.42 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  29.03 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  29.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5091  hypothetical protein  31.76 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135209  normal  0.26552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0348  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4709  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365638  normal  0.665759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00276  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3306  hypothetical protein  30.72 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00273  predicted inner membrane protein  30.12 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.764997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3289  protein of unknown function DUF1097  30.72 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0335  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0377  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.656327  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05920  hypothetical protein  27.61 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1155  hypothetical protein  30.25 
 
 		 163 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2293  hypothetical protein  30.25 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3458  putative transmembrane protein  32.26 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2563  hypothetical protein  29.63 
 
 		 173 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.232461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01040  hypothetical protein  29.63 
 
 		 163 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000191  hypothetical protein  27.92 
 
 		 160 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0212289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1415  hypothetical protein  30.06 
 
 		 163 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0524852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2097  hypothetical protein  29.63 
 
 		 173 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1154  hypothetical protein  29.63 
 
 		 163 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.308865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2609  protein of unknown function DUF1097  29.63 
 
 		 173 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00104485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01033  predicted inner membrane protein  29.63 
 
 		 163 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  30.13 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>